科研人员首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制

      小黄鱼是中国重要的海产经济鱼，味道鲜美，广受青睐。

      近日，记者从浙江省农科院获悉，该院水生生物研究所小黄鱼科研团队与美国奥本大学、厦门大学合作，首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制，为建立小黄鱼基因组选择育种、培育高产抗病优质良种提供了基因资源和技术手段，相关研究论文近日在线发表于学术期刊《分子生态学资源》上。

      2021年，浙江省农科院等单位通过连续8年产学研联合攻关，突破了野生小黄鱼驯活、人工催产和全人工规模化繁育关键技术，实现小黄鱼网箱养殖规模化生产。随着小黄鱼全养殖产业的扩大和科研的深入，破译小黄鱼基因组，发掘生长、性别决定等相关重要功能基因成为摆在科研工作者面前的重要课题。

      “黄鱼属拥有东海四大海产中的小黄鱼与大黄鱼两个重要经济鱼类，虽然它们形态和染色体核型相似，但是黄鱼属物种之间的遗传关系尚未明确。”论文第一作者、浙江省农科院水生所助理研究员谢庆平博士介绍，本研究通过结合四类基因组测序技术，构建了小黄鱼染色体水平的基因组精细图谱；揭示小黄鱼基因组大小为706 Mb，注释基因为25233个；进化分析表明小黄鱼与大黄鱼亲缘关系最近，大概在2540万年前开始分化。

      谢庆平介绍，鱼类雌雄同体和雌雄异体的演化方向，在学术界仍然是一个有待解决的有趣谜团。此次研究通过转录组学、比较基因组学以及分子生物学的技术方法，鉴定出dmrt1基因为小黄鱼的雄性特异性基因，且dmrt1基因序列的演化可以作为鱼类中雌雄同体现象产生的生物标记。

      论文通讯作者、浙江省农科院水生所所长楼宝研究员表示，小黄鱼全基因组的解译和基因组精细图谱的绘制，对于海洋渔业资源保护、小黄鱼养殖产业化以及分子遗传育种技术的研究意义重大，可以为科研人员开展小黄鱼种质资源挖掘保护、经济性状的遗传解析和建立以基因组为基础的辅助育种平台。